但是日军的机群却和历史上一样没有轰炸珍珠港的海军船坞和军用油库，因为按照山口多闻的作战计划，首先必须摧毁瓦胡岛乃至整个夏威夷群岛的防空力量，包括机场和航母上的飞机，以及地面和军舰上的防空火炮、尤其是可以发射近炸引信炮弹的大口径高射炮，而射程较近的小口径高射炮则可以先放一放，因为它们所能控制的空域范围相对小得多，而且也够不着高空飞机的敌机。
在这样的要求下，仅仅比三艘航母遇袭稍晚一分多钟，瓦胡岛上的机场和部署有大口径高射炮的防空阵地也同样遭到了日军轰炸机的重点攻击，反应不及的美军几乎没来得及作出任何像样的反击，机场和地面的那些大口径高射炮就在敌人猛烈的空袭下全部失去了作用，而这个时候，港内航母以外的其他军舰也都已经遭到了日军的攻击。
由于第一波攻击时轰炸机携带的基本都是高爆炸弹，因此日军的轰炸机飞行员们很明智地将攻击的目标集中在了重巡以下的薄皮军舰身上，至于战列舰这样的大家伙，日军的轰炸机虽然也丢下了一些炸弹，但目的只是为了摧毁舰上威胁巨大的大口径高射炮，而不是要将这些战列舰炸沉，因为高爆炸弹除非当量大到一定程度，否则很难给战列舰造成致命的破坏。
可是日本海军的陆战队想要在瓦胡岛登陆，这几艘巨舰就非得击沉不可，对此山口多闻早有准备，此时已经潜入港内的日本袖珍潜艇就背负了这样的重任，而且第二波攻击的轰炸机当中也有相当一部分携带了重磅穿甲航弹......
停泊在整个战列舰群最外面的“加利福尼亚”号战列舰首先遭到了潜艇鱼雷的攻击，舰体陈旧的“加利福尼亚”号战列舰水下防御力和抗沉性都明显不如这几年列强先后入役的新式战列舰，侧弦被三条鱼雷击中后，“加利福尼亚”号战列舰很快就沉没了......
舰龄稍短的西弗吉尼亚号战列舰运气要好一些，在这轮攻击中只被一条鱼雷击中，本来并不致命（袖珍潜艇只能发射450mm口径的轻型鱼雷），但由于并非处于临战状态，水密舱没有完全关闭，致使海水不断涌入，舰体因此迅速下沉，好在停泊的位置水深较浅，最终搁浅在了港内。虽然没有完全沉没，但是严重倾斜的舰身以及所剩无几的人员都让这艘标准排水量超过3万吨的巨舰完全失去了作用......
而美国太平洋舰队的旗舰、也是舰龄最老的“宾夕法尼亚”号战列舰上虽然值班人员最多，但却不幸地被4条潜艇鱼雷先后命中，之前还刚被一枚1.8吨超重高爆航弹命中，舰体本就受创不轻，结果伤上加伤，挣扎着开动了几百米后就倾覆翻沉在了港内......
“宾夕法尼亚”号战列舰的姐妹舰“亚利桑那”号是最幸运的一艘，由于位置的关系，它在日本袖珍潜艇的攻击中没被一条鱼雷命中。但是好运并没持续多久，匆忙登上座舰的美军官兵们好不容易将这艘军舰发动起来，日军派出的第二波攻击机群就已经飞到了它的上空......
一架九七式舰载攻击机在3000多米（注1）高空投下的一枚800公斤穿甲航弹不偏不倚地砸中了亚利桑那号战列舰的前甲板，首先引爆了水上飞机弹射器的黑火药库，由此又引爆了主炮塔的无烟火药库。亚利桑那号的舰桥在爆炸后坍塌，舰体前面被炸出了一个巨大的破口，导致整个舰体沉没，1177名官兵阵亡，包括舰长范.瓦尔肯伯格上校......
至此，珍珠港内的4艘美国战列舰全部完蛋了，幸好不久之前美国的战列舰被大量调往东海岸准备参加对德作战，还有一艘战列舰此时刚好不在港内，因此停泊在港内的数量比历史上的8艘战列舰少得多，否则损失还要惊人。这对美国人来说，可以称之为不幸中的万幸，而日本人如果知道历史上的珍珠港事变，或许会喜大于忧地自嘲“有得必有失”吧？
除了7艘主力舰，日军的两次攻击波还先后炸沉（包括像西弗吉尼亚号战列舰这样搁浅了的）重巡以下的其他战舰（不包括满载排水量千吨以下的小艇）12艘、炸沉和迫降非作战舰船11艘，而瓦胡岛上的所有机场早就已经被炸得没法再起降任何飞机，而地面的大口径高射炮也全都哑火。到了这个时候，瓦胡岛上的防空能力已经几乎完全丧失，而夏威夷其他岛屿上的机场也都遭到了日本机群的扫荡......
“在美军一架飞机也没能升空、大口径高射炮也没起到什么作用的情况下，居然也损失了一百多架飞机，低空轰炸固然可以避开雷达侦测、精度也非常高，但小口径高射炮、乃至高射机枪的威胁却也增大了许多......”，山口多闻看过初步汇总上来的战报后暗自沉吟道。好在损失虽然很大，但最重要的目标还是达成了，那就是清除瓦胡岛及其周边的防空力量，以便舰队可以从容地对付瓦胡岛上坚固的要塞群......
夏威夷虽然现在还没有正式并入美国的版图，但成为美国海军太平洋舰队的最主要基地已经很久了，瓦胡岛作为主岛，更是早早就修建了大量的坚固要塞，与战列舰型号相同的406mm要塞巨炮（13座炮塔，每座2门，一共26门巨炮。）威力极大，不把它们解决掉就开始登陆的话，无异于让陆战队的官兵们集体送死。但是美国人自然也知道这些巨炮的价值，专门为其设计和修建了无比坚固的要塞，将其保护得严严实实，由6.1米厚的土石层、2.44米（炮击口上面的挡板厚达3.66米)厚的钢筋混凝土和305毫米厚的钢板（嵌在钢筋混凝土层之中）所叠加起来的超强防护（ps：这还是炮台当中防御最弱的一个，瓦胡岛要塞群的防护之强远远超出了二战时期的要求，让日军也误算了一次，山口多闻已经够谨慎了，也只是按照德军提供的马其诺防线资料再加强了一些进行估算的。），即使是如今世界上威力最大的战列舰主炮也奈何不了，除非运气好到能够刚好从要塞的炮击口打进去......
注1：由于第一波攻击已经重创了美军的飞机和大口径高射炮，第二波攻击因而不再采用超低空突防的战术，而改用高空投弹的方式，一方面是为了规避美军的小口径近防火炮，另一方面则是由于只有投弹高度足够、才能发挥出穿甲航弹对于高防护目标的破坏力。