这场仗打了三天三夜终于击败九黎部落，活捉了蚩尤。九黎战士见蚩尤被擒获，没有了战意，除了少数拼命抵抗外，大多数归顺了轩辕。轩辕安抚了归顺的九黎族后，消灭了顽抗分子，率军押解着蚩尤返回了自己的部落。
轩辕返回部落，对天下万民宣告了蚩尤的罪状，之后下令将蚩尤处斩。
刑场由轩辕亲自主持，而即将行刑的蚩尤一脸不屑的看着轩辕，轩辕见行刑时间移到，大声说道：“行刑！”刽子手立即用大刀砍在蚩尤的脖子上，“咔”的一声，由于蚩尤为巫族后裔，肉身强悍，大刀断为两截，却没能伤及蚩尤分毫。轩辕急忙命令换一把快刀，试了数次，却未能杀了蚩尤。
蚩尤哈哈大笑：“我乃大巫之体，刀枪不入，想要杀我？做梦吧！”
广成子对蚩尤说道：“蚩尤，你虽却是刀兵难伤，可若说是不死之身，那却是笑话！这天地间，只有圣人才是不生不灭的，圣人之下，谁敢说自己是不死的？莫要忘了轩辕手中的轩辕圣剑乃是屠巫剑而来，曾将祖巫化作灰灰，你怎可抵挡？”
轩辕闻言，精神大振，拔出轩辕剑狠狠向蚩尤砍去。这轩辕剑前身是戮巫剑，连祖巫都可以杀害，何况蚩尤的大巫之体？
只见轩辕剑向蚩尤脖子砍去，锋利无比的轩辕圣剑，毫无阻碍一剑斩下了蚩尤的头颅。
轩辕黄帝看着蚩尤的头颅，仰天说道：“蚩尤头颅已被吾斩杀，无数无辜冤死的人族英魂啊！你们可以安息了！”
“哈哈哈。。。”
突然一阵诡异的笑声响起，轩辕黄帝惊骇无比的望去，只见蚩尤那无头之躯根本没有流下一丝鲜血，那被斩下的头颅正在疯狂的大笑着。
原本厮杀的战场此刻瞬间停止，望向那蚩尤所在的方向，心中惊骇无比。
“哈哈哈。。。公孙轩辕，本座早就说过，吾乃不死之身，即便是那轩辕圣剑也休想斩杀我蚩尤！哈哈。。”
蚩尤笑罢，口中喃喃念诵着什么，那被斩落的头颅瞬间飞至断颈处光华一闪，再次紧密无间的联系在一起。
轩辕黄帝看着这诡异无比的景象，心中亦是震惊不已，不过面上却是不显丝毫，道：“蚩尤，即便你有此保命神通，今日你也死定了！”言罢，再次挥动手中的轩辕圣剑将那蚩尤的头颅以及四肢斩下。
那被斩下的身体部分还在活动，蚩尤头颅笑道：“公孙轩辕，无论你斩一万次还是无数次结果都一样，吾修成了无相元神，元神不灭，吾便是不死之身！”
轩辕黄帝紧皱眉头，心中苦苦思索。
这时那广成子说道：“陛下，贫道师弟赤精-子有一宝贝，名曰阴阳镜，定可克制这蚩尤！”
轩辕黄帝大喜，望向赤精一子道：“还请师叔相助！”
赤精-子闻言淡笑道：“陛下不必客气，贫道自当相助！”言罢，取出阴阳镜，白红二色闪烁不断，把白色的一面照射在蚩尤的身上。
只见蚩尤在白光的照射下，依然无所畏惧，面带笑意的望向众人。
“怎么可能，阴阳镜竟然不起作用！”赤精一子大惊失色。
众仙亦是大惊，忍不住暗道：难道这蚩尤真是不死之躯吗？
就在众仙暗暗苦恼之际，只见天际上却是飘来一朵祥云，轩辕看去只见那祥云上屹立的女子正是九天玄女。
九天玄女落下云头，对着轩辕黄帝一拜道：“人皇陛下，小仙奉玉帝之命以此宝镜相助人皇陛下斩杀蚩尤，建立不世之功！”
轩辕大喜不已，闻言谢道：“劳烦仙子代为转告玉帝，轩辕多谢了。”
九天玄女点了点头，手持昊天镜对准蚩尤，只见镜子闪烁出一层毫光，光华一闪照射在蚩尤的身上。
蚩尤立马感觉到一股危机感传来，自身修成的无相元神瞬间被一股玄奥的力量所封印，心中惊恐不已，望向那宝镜眼中露出浓浓的恐惧！
轩辕手持轩辕剑上前一剑斩下蚩尤的头颅，只见这时蚩尤身躯终于流出鲜血，轩辕大喜又连斩四剑斩下蚩尤的四肢。
那广成子道：“这蚩尤不知修炼的何种神通，竟然这般诡异，为了日后避免其复活还是将他身躯分别置放在天地五处，借助天地之力镇压！”
轩辕道：“老师此举大善，就依老师之言！”
却是命人找来龙马，将蚩尤的头颅，四肢连接的躯干部分运送到五岳之地，在辅以无数阵法禁止将封印之地布置的固若金汤，日夜命人看守。
九黎之乱既平定，四海龙王一齐上前对轩辕说道：“蚩尤既已被陛下封印，吾等亦该重回四海，望乞告辞！”
轩辕微微施了一礼，道：“今日多谢众位道友相助，若无四海龙族，此战即便是胜了也是损失惨重，今日轩辕愿意奉龙族一族为我人族瑞兽，享我人族香火！”
四海龙王大喜，他们此行的目的就是相助人皇完善功德，如今亲口得到人皇允诺得享人族香火而且更是被人族奉为瑞兽，让世世代代的人族供奉。这样一来，自然不用担心自身的种族气运传承，相反还会在人族气运的帮助下，自身种族的气运不断的壮大。
四海龙王同道：“如此谢过人皇陛下！”旋即又与众人一一行礼道别，呼啸一声，万千金龙纵云驾雾，瞬间告辞而去。
卢圣见轩辕打败了蚩尤，向轩辕告辞。轩辕听闻卢圣要走，出言劝阻道：“上次一战，多亏了圣师相救，轩辕才能侥幸活命。如今轩辕还未报答仙长大恩，圣师怎可离去，还望圣师在多逗留些时日，也好让轩辕有机会报道圣师的大恩大德！”
卢圣道：“人皇，你与蚩尤之间的争斗已经结束，不知你对九黎部落及人族的发展有何看法？”
轩辕说道：“九黎部落以下犯上自当是坚决打击，不能让他们再有反抗的机会，至于人族未来的发展则是集中管理，以杜绝一些小部落不听命令的行为。”
卢圣听到轩辕此言，不禁摇摇头，说道：“人皇，蚩尤与你之间的争斗属于上层的纷争，不应该牵连到下层的一般百姓身上，人族在你与蚩尤争斗的这数十年中，生活的水平已是跌到了低谷，再也经受不起任何打击，希望你能三思而行，不要因一时之气而使人族再受磨难。”
轩辕不以为然地说道：“蚩尤勾结巫族，带领九黎部落以下犯上自当从严处罚，否则那岂不是要天下大乱。”
卢圣说道：“人族大兴，虽是天道大势，而人皇之争也是天道对人皇的考验，如果人皇连这点灾难都无法解决又如何能带领人族走向兴盛。现在战争已经结束，人皇应该对九黎百姓一视同仁，采用怀柔政策收取民心，这样天下才能大同。人族才能迎来大兴的日子。”
言如醍醐灌顶，轩辕氏本是天纵奇才，当即恍然大悟。遂向卢圣深施一礼，道：“圣师之言，字字珠玑，令我茅塞顿开，姬轩辕谨谢圣师之德。”
卢圣连忙扶起轩辕，笑道：“人皇不必如此！如果人皇能以仁和之心来治理天下，人族大兴的日子不远了！”
卢圣说着便离开人族，回到西方，向准提复命。
自此人族进入了人皇轩辕的时期。人皇轩辕在卢圣的劝说下，放弃对九黎部落的屠杀，九黎部落逐渐融入了人族。人族大兴终于来临。在轩辕的努力和一系列变革之下，人族气象更新，更加兴旺了，轩辕在人族的威望更加高了。