李自成入南京之后，便被押入了大中朝刑部大牢之中，被严密的看管了起来，按照大中朝时下的制度，李自成将会被移交到大理寺进行审判。
李自成身负沉重的脚镣枯坐于牢房之中，关押他的牢房条件并没有像他起初想象的那么阴森可怖，而且这一路上行来，除了没有自由之外，沿途押送他的那些大中军兵将也没有刻意的虐待于他，正常的吃喝基本上保证了他的需要，即便是到了南京城，也没有让他坐囚车带枷游街示众，而是低调的被大中朝的司狱接管过来，装入了一辆大车运送到了刑部大牢之中。
李自成此时早已是万念俱灰，心知已经无法幸免，当初被田见秀率人抓住的时候，他也曾经想过要避免被辱，干脆自杀拉倒，但是大中军对他的看管甚严，几次自杀企图都被看管他的人员发现制止，使得李自成数次自杀未遂。
李自成被移送到西安府之后，发现大中军并未太过为难于他，虽然膳食上比较粗糙，但是也没有刻意的饿着他，故此几次自杀未遂之后，李自成也就不再试图自杀了，只是静候着对他最后的处置。
他很清楚像他这样的人，大中朝是绝不会留下他的性命的，他被杀只是一个时间的问题，而且很可能像当年他舅舅高迎祥那样，被大明朝千刀万剐，但是这对于李自成来说，已经没有什么回旋的余地了。
假如在大中朝立国之后，他便宣布投顺大中朝的话，估计着肖天健还能给他留下性命，但是现在他已经不指望肖天健还能让他活下去了。
这些日子，李自成一直在回顾自己的一生，他从最初的一个驿卒，到后来叱诧疆场的义军首领，再到大顺皇帝，当然他这个皇帝的水分比较大，但是好歹也曾经拥有过部众数十万，可是短短半年多时间，他的一切便在大中军的兵锋之下灰飞烟灭，一切都成为了过去式。
他这么多年来，一直在想，他到底比肖天健差在什么地方，可是这个问题也困扰了他很多年，他一直没有想通，他起兵造反的时候，肖天健这个人还不知道在什么地方，等他领兵打陇州的时候，肖天健也不过只是一个拥兵不足千人的小头目罢了。
可是偏偏他在名气远大于肖天健的时候，肖天健却忽然间便崛起于各路义军之中，一手打造出了一支彪悍无匹的兵马，愣是在短短的几年时间之中，便硬将庞大无匹的大明王朝生生掀翻，控制了大半个中国。
李自成枯坐于牢房里面，最终还是没有想通这个问题，他到底是哪儿不如肖天健，肖天健能取天下，可是他却从头至尾都不过只是一个流寇。
正在李自成坐在牢中想着这些问题的时候，听到了牢房外面有人叫道：“恭迎圣上驾到！……”
李自成听到之后，心中突突猛跳了几下，抬起了头，朝着牢房外面望去，昏暗的牢房外面，这个时候忽然亮起了好几个灯笼，将牢房内外照的通亮，使得已经习惯了这种昏暗环境的李自成的眼睛有点适应不过来，于是闭上眼然后再次睁开，努力的朝着监牢外面望去。
这个时候他看到了一个身材高大的男人，身穿着一件黄色的龙袍出现在了牢房之外，这个时候能穿这样的龙袍之人，李自成自然知道他的身份了。
“都免礼吧！近卫留下，其他人先退出去，不要打搅朕说话！”门外的黄袍男子朗声说道。
只听得狱卒们连忙答应之后，立即便鱼贯退出了牢房，有人哗啦一声打开了牢房上的铁索，咣当一声推开了牢门。
李自成本来想要站起来，但是想了一下之后，再一次坐回到了凳子上，抬起头朝着走入牢房的这些人望去。
几个身形彪悍的侍卫立即先走入牢房，一个个按着腰间的腰刀的刀柄，虎视眈眈的盯着李自成，接着那个身穿黄袍的男子跟着走入到了并不算狭窄的牢房之中。
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第一百七十七章 猫哭耗子
“李兄别来无恙？在这里可还住的舒服吗？可受了什么委屈？”肖天健背着手缓缓走入牢房之中，定睛观看了一下坐在凳子上没有起身的李自成。
“大胆狂徒，见到圣上为何不跪？”一个侍卫厉声对李自成喝道。
“罢了！此乃故人也！就不要讲究那么多了！”肖天健挥手让侍卫闭上嘴退到一旁，很快有人搬来了一张大椅，放在了李自成的对面。
肖天健抖了一下袍子，缓缓的坐在了李自成的对面。
李自成冷笑着看着肖天健，总觉得肖天健这会儿脸上带着一副小人得志的表情，忍不住心中怒火大起，冷笑一声道：“圣上？朕也是皇帝，为何要跪他？”
“大胆，李贼，你找死不成？”一个侍卫听到李自成如此大逆不道，立即便想要上去修理他一番。
但是侍卫的行动还是被肖天健阻止了下来，肖天健看着李自成，心情颇有些复杂，后世李自成被一些人刻意的塑造成了一个悲剧英雄人物，但是在这个时代，肖天健却很清楚李自成是个什么样的人物。
但是不管怎么说，李自成都称得上是一个枭雄，这一点是不能否认的，而且此人性情坚忍不拔，这也是事实，本来如果没有他的意外穿越来到这个时代的话，此人眼下还应该混的风生水起，再有两年时间，他便会领兵杀到北京城，将大明王朝覆灭，可是现如今却……
肖天健也不太清楚，今天他来这里，到底想要做什么，但是作为一个同行兼对手，他总觉得就这么悄无声息的杀掉李自成，有点说不过去，他来到这个时代抢了他李自成的果实，现如今更是让李自成成为了他的阶下囚，所以肖天健考虑再三之后，还是决定要来送一下李自成。
“想来你我自陇州一别之后，也已经有很多年没见面了！但是没成想今日却以这种方式，在这个地方再见到你，真是让朕感慨良多呀！”肖天健开口对李自成说道。
李自成鄙夷的看了肖天健一眼，挺胸答道：“成王败寇，我李自成有今日，全乃是拜你所赐！你今日前来这里，不过只是想要看看某的狼狈罢了！现在看过了，还有和话可说？要杀要剐随你便是！哼！”
“呵呵！李兄这些年来，脾气倒是没变多少呀！你我好歹也是故交，难不成就没话可说吗？”肖天健放松了身体，坐在椅子上，对李自成笑道。
“话？说什么？想当年，你不过只是一个小小的头领，但是现在却成了皇帝，我这个草寇又有什么可跟你说的？”李自成一脸的怒气，对肖天健说道。
肖天健也不生气，身体朝前倾了一下之后，对李自成说道：“我想要问你，当初你起兵造反，想来也是为了吃饭罢了！我相信你也曾经想过，要解救万民于水火之中，但是既然看到天下大势所趋，可又为何不肯放弃，非要同我为敌呢？”
李自成眼睛一瞪道：“这天下凭什么你坐得，我李鸿基却坐不得？说到底你我也不过是一路人，只不过我运气不如你罢了！现如今你成就了大业，自然容不得我这样的人，否则的话你我又如何会兵戎相见？”
肖天健摇摇头，看来他和李自成之间，还真是没有什么共同语言，这样的谈话其实也没有什么意思，这让他颇为失望，他倒不是想要来看看李自成的笑话，现如今两个人之间根本没什么好说的，他的理想岂是李自成可以了解的，对于李自成来说，他想的最多的不过就是想像历朝历代的皇帝那样，登临天下藐视群生罢了。
于是他对李自成问道：“这恐怕不是什么运气的问题，想当初不管是你，还是高迎祥乃至是张献忠等等，哪一个不比我肖天健名气要大，可是最终的结局呢？最关键的问题是你到现在知道，你为何会成为失败者吗？”
李自成冷笑一声道：“你不过只是会造火器罢了！如果真刀真枪的话，我岂能不是你的对手？”
肖天健摇头道：“非也非也！你还是没有想明白！这不单单只是我的兵马火器犀利的原因，而是民心！”
“民心？……”李自成皱眉道。
“对！就是民心！你我虽然都是起兵造反，最初的目的大概也相同，但是等到了后来，你便忘了为何要起兵造反了！你和你的手下大将们更多的想的却只不过是享乐罢了！在你们的眼中，老百姓名儒草芥，不过只是消耗品，供你们驱使罢了！本来你在陕西还可以大有作为，但是却为了一己之私，忘了起兵造反的初衷，最终失了民心！
如果不是这样的话，我岂能轻易便将你打败？今日我来见你，并非是想要看你的狼狈，而是想要让你明白，你为什么会失败罢了！即便是没有我的出现，只要你没有想明白这一点，你迟早还是会失败的，即便是不会败给大明，你迟早也有一天会败给建奴！因为你心中早已没有了百姓二字！
当初我派人跟你说过，大明将亡，百姓思安，希望你能放下私念，率众归降于我，那个时候你便应该知道，其实以你的实力，是无法与我对抗的，但是你却还是选择了继续与我为敌，宁可以陕西数百万民众的性命为代价，不过就是想要满足你当皇帝的私心，所以在那个时候，便已经注定了你的失败，你视百姓为猪狗，而百姓弃你也如同敝履！”肖天健接着对李自成说道。
听罢了肖天健的话之后，李自成愣了一下，虽然他还是觉得不服气，但是想想近年来他和手下的诸将在陕西的所作所为，却是是失了民心，不断的扩军，搞得陕西境内天怒人怨，大中军一来，他的大顺军便瞬间崩溃，老百姓也纷纷投靠大中军，为大中军助战，传递消息，结果使得他短短半年时间，便被打回了原形。
李自成到了这会儿，也没什么可以争辩的了，不由得叹息了一声点点头道：“大概你说的不错，总之是我败了，这一点上我不如你，事已至此，你想如何处置于我，便自便吧！”
肖天健站起身来，对李自成说道：“很好！既然如此，不知你还有何遗愿没有？”
李自成微微的抖了一下之后，对肖天健问道：“但不知此次田见秀带人抓了我之后，我的夫人现在何处？假如她没死的话，可否求你留她一命？另外我死后，可否将我的尸身运回原籍埋了？”
肖天健点头道：“你问的是高夫人吧！据我所知，高夫人在被俘之后不久，便已经绝食自尽，已经被安葬在了汉中府外，至于你的要求，我可以满足，你死之后，朕会下旨将你遗骸送回米脂择地安葬！”
听到了高夫人的死讯之后，李自成一下沉默了下去，他虽然这辈子有不少女人，但是他却两度被他的女人戴了绿帽子，唯独这个高夫人跟了他之后，一直追随着他，帮他打理各种事务，现如今她却先绝食而死，早他一步撒手人寰，这让李自成颇为伤感。
“既然她已经死了，那么恳请圣上在我死后，能将她的遗骸也迁回米脂，与我同葬！李某自知罪孽深重，但是还望圣上恩准！”李自成沉默了一阵之后，起身跪了下去，对肖天健叩头说道。
肖天健看了一眼李自成，叹息了一声道：“你能在这个时候说出这样的话，朕岂能让你失望，就准你所请好了！”
十天之后，经过大理寺的审判，李自成共被定下了十条大罪，其中以谋逆、滥杀平民等罪为主，判李自成寸磔于市，寸磔就是凌迟，说白了就是活剐。
但是肖天健却最终法外开恩，赦李自成凌迟的刑罚，改为斩立决，于六月初三午时在南京城内的街市口将李自成斩首。
听闻要处斩李自成，南京城内外顿时轰动，许多人都想见识一下这个纵横天下十余年的李自成到底是什么样的人物，于是纷纷走出家门赶往街市口一带观斩，一下把街市口一带给挤了个水泄不通，刑部没有想到会来这么多人观斩，最后不得不改为将李自成移到城南门外处斩，最后李自成在受刑之前，跪下对城内皇城方向磕了三个头，作为对肖天健特意开恩的答谢，没有再多说一句话。
随着三声追魂炮响起之后，刽子手雪亮的大刀寒光一闪瞬间落下，一代枭雄李自成便被斩于南京城外。
事后按照肖天健的旨意，刑部为李自成准备了一口不错的棺材，收殓了李自成的尸身，然后派人将他的棺木送往了他的老家陕西米脂，择了一地下葬，同时将他的夫人高氏的尸骸也从汉中府起出，也送往了米脂县跟李自成葬在了一起。
至此一代枭雄终于揭过了他辉煌的一页，同大明朝一样，成为了一段历史。
肖天健事后专门着令修史馆，为李自成单独修史，详细的记录了李自成的生平，收入到了明史之中。
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第一百七十八章 内阁
天元二年的中旬，整个南方接连雨水不断，再加上福建两广一带的地形复杂，关隘众多，虽然大中军集结了不少的兵力，但是在这样的气候之下，对于擅长使用热兵器作战的大中军来说，雨季给大中军制造出了很大的麻烦。
另外由于地形的限制，也造成了大中军后勤保障的困难，所以整个南方的战事情况在最初大中军取得了一定的成果之后，便暂时性的陷入到了胶着状态。
不过这对于肖天健来说，也并不是非常着急，因为他也很清楚解决掉郑家和永历小朝廷这件事，并不是一朝一夕便可以解决的，南方作战有一定的特殊性，虽然不见得要打成持久战，但是想要几个月的时间之中，便将整个南方诸省都平定下来，也不是件容易的事情。
更何况这一次在福建用兵，最主要的目的并不是彻底消灭郑家在福建的势力，主要目的还是给郑家施压，所以在石冉和刘耀本打下福宁州，进而又控制了整个建宁府之后，福建方面的战事便暂缓了下来。
而且海上这段时间因为风浪很大，海军的行动也随即跟着暂停了下来，不过这几个月的军事行动，还是给郑家集团造成了很大的压力，并且给予了他们很大的打击。
许多郑军被迫倒戈投降了大中军，就连海军方面，也招降了一批原来从属于郑家的一些海盗，获得了上百条各式船只，招降了两三千郑家的部众以及小股海盗，整体局势对于大中军十分有利。
如果不是这段时间雨水太多，严重影响到了军事行动的话，以石冉和刘耀本的实力，打下福州府也并不是非常困难的事情。
至于盘踞在两广一带的永历朝廷，这段时间在罗汝才所部的攻击之下，日子也过的相当艰难，永历帝在手下诸臣的怂恿之下，生怕大中军自韶州长驱直入打到广州城下，于是慌忙之间便逃往了广西南宁避难。
但是看似简单的这件事，却在广东引起的巨震，本来广东官兵还打算跟着永历干一番事业，即便是韶州大败之后，但是却并未放弃，而是摩拳擦掌的想要在广州府一带再和大中军分一个高下。
但是没成想就在官兵们准备和大中军死磕的时候，永历帝却带着一众当官的弃了广州府，逃往了广西南宁，这一下对于广东的明军兵将们来说，打击非常之大。
永历此举无疑等于是放弃了整个广东，所以在得知永历帝逃往了南宁之后，广东守军当即便士气大跌，而那些原本还想效忠于大明的官民，到了这会儿明白了过来，大明已经不足为他们的依靠了，故此在永历逃离广州之后，永历朝在整个广东可谓是民心大失。
虽然大中军因为各种原因，在控制了南雄和韶州之后，停止了继续朝广州府攻进，但是广东的明军兵将还是有不少人开始主动和大中军联络，只待谈妥条件之后，便投降大中朝了。
永历此举不单单是丢掉了广东人的人心，同样对于郑家来说，心理上的打击也很大，本来郑家还可以背靠广东，和大中朝为敌，但是永历突然间放弃广州府逃往南宁，让他们背后顿时也空门大开。
一旦进入广东的大中军攻下广州府，那么对于他郑家来说，便几乎是灭顶之灾，使得他郑家顿时陷入到腹背受敌的状态之下，所以永历逃离广州府，不单单影响到了广东军民的士气，同样也严重影响到了福建的郑氏集团的生存。
于是郑家在六月之后，更加频繁的开始和大中朝联系，商谈有关他们投顺大中朝的事情。
肖天健这一次干脆直接在朝中吏部之下选派了一个能说善辩的官员，名叫张天成，曾经也是明朝旧吏，曾在河南任官，后来比较早投降了刑天军，因为能力不错，一直干到了吏部侍郎之职。
这一次郑家要求和谈，单有前期派去的钱谦益显然不太够用，于是肖天健变将这个张天成作为大中朝的谈判使节在七月间派往了福建泉州，作为大中朝的全权代表和郑芝龙进行最后的谈判。
虽然随着南方战事的顺利开展，内地的情况也逐步的平定下来，各地都呈现出了一片欣欣向荣的景象，但是肖天健这个皇帝却忙的是不可开交，因为百废待兴，各地呈报上来的奏疏多如牛毛，这个时候肖天健才体会到了当皇帝的不易，要想当一个好皇帝，做一个明君，必须要起早贪黑的批阅各种各样的奏章，还要关注着各地的政务、军事，肖天健不敢大意，忙的是不亦乐乎，可是即便如此，还是不能处理完各种政务。
就连他每日早晨起床习武的习惯，这个时候也开始因为过度的繁忙而荒疏了下来，幸好他的老婆不多，要不然的话用不了多久，恐怕他就坚持不住了。
而且最让肖天健不爽的还不是这些事情，他的专业学的是机械，他在立国之初，便想要大力发展大中朝的工业，但是当了这个皇帝之后，他却发现，他几乎没有一点时间来搞他的专业，有心想要抽点时间设计出一些机床，作为发展工业化的基础，但是时间却一点也抽不出来，甚至于连陪陪老婆孩子的时间他都没有。
这让肖天健感到很是不如意，于是琢磨了一阵之后，便决定暂时效仿大明设立内阁大学士的方法，来让一些大臣来帮助他处理政务，他当皇帝可不是为了大权独揽，把自己累的像驴一般，他还有许多事情要做，如果整日间全部都被埋在这些乱糟糟的奏章之中的话，就不是他的本意了。
另外他还要关注着各地的军事情况，军队在这个时候也需要不断的进行调整，原来的几个镇军，到现在随着大中朝掌控了越来越多的地盘之后，已经不太适应了。
每个镇军现在所辖的区域实在是太大，除了主帅军权太大之外，也有些顾忌不过来，所以肖天健变有心想要在分出几个镇军，像后世的几大军区那样，来负责各地的军事。
可是因为政务太忙，肖天健却无力抽出足够的时间来做这等事情，于是考虑再三之后，他决定成立一个内阁，设立内阁大臣，作为给他帮忙的手段。
大明的内阁大学士制度其实是有一定的可取之处的，说实在的，大明朝的皇帝勤政的根本没有几个，除了最初的朱元璋、朱棣和后来的崇祯之外，其余的皇帝基本上都不太过问政事，吃喝玩乐倒是都很在行，万历皇帝更是罢朝近三十年，几乎根本不理朝政，但是正因为内阁大学士撑着大明的门面，皇帝不管事但是政务却照常进行，也没有因为皇帝不理朝政而导致大明垮台。
所以某种程度上这种制度，还是有一定的好处，起码可以让皇帝抽出身，来做些其他事情，更何况他搞出这个内阁大臣的制度，也不是说就不理朝政了，重要的事情他还是会盯紧的，而且早朝也不会废掉，更多的实物性的事务，完全可以交给内阁大臣来处理，这样的话他便可以抽身出来。
于是肖天健便在七月间将卢象升从北京调回了南京，虽说大中朝定都北京的事情已经确定，但是肖天健也留出了两年的缓冲期，目前大中朝的政治中心还是在南京，而且北方在建奴山海关大败退回关外之后，再加上有罗立、李定国等大将驻守北方，短时间之内，不管是建奴还是蒙古人都不敢再轻易犯边，而且卢象升在这一年时间里，也将顺天府的事务处理的差不多了，留着他在北京也是浪费，故此肖天健干脆便将卢象升调回了南京城。
通过和诸臣商议之后，肖天健在大中朝组阁，建立起了一个内阁大臣制度，卢象升充任第一任内阁总理大臣，至于诸部的尚书，则全部入阁充作协理大臣，另外肖天健还令孙传庭也进入到了内阁之中，作为一个协理大臣，帮助卢象升来做事。
这些大臣们的行政能力都是相当强的，上面再加上有肖天健来掌舵，有卢象升这个公心甚重之人来主持内阁，肖天健没有什么不放心的。
于是在八月的时候，内阁便开始了运转，各种繁琐的政务开始移交到了内阁之中进行处理，一般的事情内阁大臣商议之后，便可以以内阁的名义批复下去执行，一些大事特别是军务方面的事情，则在内阁之中议定以后，呈交给肖天健来最后拍板，如此一来大量的行政事务便转到了内阁之中进行处理，大大的减轻了肖天健的负担，将他从繁重的政务之中给解放了出来。
这令肖天健大大的喘了一口气，对于这次组建内阁大臣的事情，朝中诸臣基本上没有提出什么反对意见，毕竟大明之前也有内阁大学士来帮助皇帝主持政务，现在肖天健推行内阁制度，也不算是出奇，而且肖大皇帝愿意将一部分权力下放到他们这些重臣手中进行处理，这也是他们乐见其成的事情，虽然他们都是大中朝的大臣，但是也不想所有的大权就这么一直都被肖天健控制着，现如今肖天健主动提出来，让内阁大臣们来处理一些政务，对于他们来说自然是好消息，谁要是提反对意见的话，那就真是昏头了。
卢象升非常感激肖天健对他的这种信任，他很清楚这个内阁总理大臣的分量，说白了他现在已经是一人之下万人之上了，这个内阁总理大臣也基本上算是宰相了，不过和宰相不同的是，内阁处理政务的时候，总理大臣也要听协理大臣们的意见，有时候需要一起商量之后才能决定，而且对于内阁的成员，总理大臣也没有任免的权力，这样一来也就避免了总理大臣一人独断专行.
至于协理大臣，权力也比起以往的各部尚书有所增大，一些事情协理大臣便可以自行处理，而且各自分管一块，相互之间既有配合又有牵制，对于这样的做法，协理大臣自然也很是高兴。